Informatique appliqué à la Biotechnologie
•La
séquence génomique est un
des objets que les informaticiens connaissent bien et pour lequel ils ont
développé de très nombreux algorithmes. C’est donc très naturellement que
l’informatique et les sciences du vivant se sont rencontrées autour de la
problématique de l’analyse des séquences génomiques.
•La
bio-informatique fait
appel à de très nombreux domaines de l’informatique et des mathématiques :
algorithmique sur les séquences, les arbres ou les graphes, modèles
probabilistes, modèles dynamiques, bases de données et de connaissances,
visualisation d’ensembles de données complexes, etc. De ce fait, le principe, à
travers la bio-informatique,
d’une
introduction conjointe à l’algorithmique et à la génomique mériterait sans
aucun doute d’être exploré.
Alignement et traitement des séquences génomiques
- La
séquence génomique est un
des objets que les informaticiens connaissent bien et pour lequel ils ont
développé de très nombreux algorithmes. C’est donc très naturellement que
l’informatique et les sciences du vivant se sont rencontrées autour de la
problématique de l’analyse des séquences génomiques.
- Dans ce cours, nous allons comparer des séquences génomiques en utilisant l'alignement simple dans le but de confirmer ou infirmer
l’homologie entre deux séquences.
